blastn 入力された核酸配列と相同性を持つ核酸配列をデータベースから検索します。
blastp 入力されたアミノ酸配列と相同性を持つアミノ酸配列をデータベースから検索します。
blastx 入力された核酸配列を6通りのアミノ酸配列に翻訳し、そのアミノ酸配列と相同性を持つものをデータベースから検索します。
tblastn 核酸データベースを6通りのアミノ酸配列に翻訳してから、入力されたアミノ酸配列と相同性を持つものを翻訳後の核酸データベースから検索します。
tblastx 入力された核酸配列を6通りに翻訳し、また核酸データベースも6通りに翻訳します。それから、翻訳された入力配列と相同性をもつ配列を翻訳された核酸データベースから検索します。
tblastx -db /XXX/XXX/XXX -query ./YYYYYY.fa -out ./temp.txt -outfmt 6 -num_threads 40
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